上海中山醫(yī)院消化科由著名內(nèi)科學(xué)家林兆耆教授于1953年創(chuàng)立，1978年正式建科，朱無難教授任首任主任。1983年，劉厚鈺教授任主任。1999-2009年，王吉耀教授任主任?，F(xiàn)任主任為沈錫中教授。消化科擁有一支高水平的專業(yè)隊(duì)伍。專科門診每周6天，由副教授和主治醫(yī)師輪流坐診；每周6天均開設(shè)專家門診。2012年門診人數(shù)已逾20萬人次，其中專家門診逾6萬。目前中山醫(yī)院消化科設(shè)有兩個(gè)獨(dú)立的病區(qū)，共有核定床位106張，2012年出院人數(shù)達(dá)4100人次。住院病人多為來自全國各地的疑難重危病人，臨床綜合實(shí)力強(qiáng)，診治水平高。是衛(wèi)生部專科醫(yī)師培訓(xùn)基地、國家藥品監(jiān)督管理局中山醫(yī)院臨床藥理基地單位、內(nèi)科博士點(diǎn)和博士后流動(dòng)站。設(shè)有自身免疫性肝病、脂肪肝、慢性病毒性肝炎、慢性肝病、幽門螺桿菌、內(nèi)鏡治療、腸道疾病、胃食管反流等專病及特色門診。是我國最早開展肝穿刺的單位之一，病理診斷水平全國一流。消化科每周開展科內(nèi)業(yè)務(wù)學(xué)習(xí)，包括最新研究進(jìn)展及疑難病例討論，每月一次臨床病理討論（和復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院病理科、中山醫(yī)院病理科聯(lián)合），每年主辦國家級(jí)繼續(xù)教育項(xiàng)目兩項(xiàng)：肝病治療進(jìn)展學(xué)習(xí)班、循證醫(yī)學(xué)與臨床實(shí)踐學(xué)習(xí)班。在國內(nèi)首先提出循證醫(yī)學(xué)的概念，并將臨床流行病學(xué)研究應(yīng)用于胃腸以及肝臟病學(xué)研究，處于國內(nèi)領(lǐng)先水平。在慢性肝病診治、肝纖維化機(jī)制、內(nèi)鏡治療等領(lǐng)域的研究水平名列全國前茅，承擔(dān)多項(xiàng)國家自然科學(xué)基金研究課題、上海市科委和863課題。研究成果“幽門螺桿菌關(guān)鍵致病因子CagA、 VacA的生物學(xué)特性及其臨床應(yīng)用”獲國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng) （第二完成單位） （2007）、“肝纖維化細(xì)胞分子機(jī)制與治療策略”獲上海醫(yī)學(xué)科技一等獎(jiǎng)及中華醫(yī)學(xué)科技三等獎(jiǎng)（第一完成單位）（2008）、“消化道腫瘤及慢性肝病靶向納米藥物載體研制”獲上?？萍歼M(jìn)步二等獎(jiǎng)及教育部科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)（第一完成單位）（2007）、“慢性乙型病毒性肝炎肝纖維化非創(chuàng)傷性診斷體系的建立及其診斷價(jià)值的研究”獲上海醫(yī)學(xué)科技二等獎(jiǎng)（第三完成單位）（2006）、“慢性乙型病毒性肝炎肝纖維化非創(chuàng)傷性診斷和氧化苦參堿的治療作用” 獲中華醫(yī)學(xué)科技三等獎(jiǎng)（第三完成單位）（2006）。目前消化科共有醫(yī)師31名（不包括在大內(nèi)科進(jìn)行規(guī)范化培訓(xùn)的住院醫(yī)師），包括正高5名、副高10名、主治醫(yī)師14名、完成規(guī)范化培訓(xùn)的住院醫(yī)師2名。其中獲博士學(xué)位20人，碩士學(xué)位9人，學(xué)士學(xué)位2人。